L'Université de Rouen abrite 3 pôles de recherche majeurs de niveau européen :
- Sciences de l'ingénieur (énergétique/mécanique et informatique/électronique) : plusieurs laboratoires de recherche sont localisés à Rouen comme le CORIA
(Complexe de Recherche Interprofessionel en Aérothermochimie), le CRITT-CEVAA (Centre Régional d'Innovation de Transfert de Technologie - Centre Vibro-Acoustique pour l'Automobile) et le
CERTAM (Centre d'Étude et de Recherche Aérothermique et Moteurs),
- Hydrodynamique et Hydroacoustique : le Bassin d'Essais des Carênes du Val-de-Reuil est spécialisé en hydrodynamique navale et plus spécifiquement dans la
mécanique des fluides, le Laboratoire de Recherches Balistiques et Aérodynamiques (LRBA) de Vernon est internationalement reconnu en matière de systèmes de navigation,
- Chimie–Biologie–Santé : le site de Mont-Saint-Aignan regroupe les facultés, les grandes écoles, l'Institut Régional de Chimie Organique Fine (IRCOF), le
Centre Européen de Bioprospective (CEB).
Au Havre, l'Université s'est dotée de laboratoires de recherche dans deux domaines de pointe :
- Transport et Logistique : lié à l'activité portuaire de la ville,
- Informatique et Électronique : autour de 4 laboratoires universitaires.
Au niveau de la recherche privé, nous pouvons cité une série de laboratoires de niveau européen :
- À Rouen : MATRA SYSTEMES & INFORMATION - Traitement Informatique d'Images - (Informatique), SHELL RECHERCHE SA - Centre International de Recherche et de Développement - et
SEP SNECMA -Société Européenne de Propulsion - (Sciences des Matériaux), MATRA SYSTEMES & INFORMATION - ETS, Expertises Technologies & Services,
- Au Havre : CERT - Centre Européen de Recherche et Technique, MOF R&TSD - Centre de Recherche MOBIL, ESSO SAF - et CERDATO - Centre d'Étude de Recherche et de Développement
d'Elf Atochem (Chimie - Pétrole).
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